Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc180J3QNE4 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc180J3QNE4 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Ccdc180J3QNE4 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc180J3QNE4 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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