Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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H2-M1F7CXU4 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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H2-M1F7CXU4 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
H2-M1F7CXU4 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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