Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Unc13b-216ENSMUST00000207708 6574 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr703-201ENSMUST00000098142 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Usf3B2RUQ2 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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