Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rrn3B2RS91 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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