Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.84□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Spocd1B1ASB6 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms