Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Has3-201ENSMUST00000034385 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Col5a3Q9JLI2 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Col5a3Q9JLI2 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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