Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
OtofQ9ESF1 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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