Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc47Q9D024 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc47Q9D024 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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