Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chic1Q8CBW7 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm5281-201ENSMUST00000197542 2134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Ccnc-202ENSMUST00000102997 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Zfp112-202ENSMUST00000120006 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm7331-201ENSMUST00000118642 387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Uba52-208ENSMUST00000165126 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Wfdc11-202ENSMUST00000167694 249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 1700120C14Rik-201ENSMUST00000187706 326 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm43293-201ENSMUST00000202780 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm24145-201ENSMUST00000082631 163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Nckap5-202ENSMUST00000094609 2965 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Nrf1-205ENSMUST00000115200 2491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Ikzf2-207ENSMUST00000190771 2483 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Lpar1-204ENSMUST00000107574 3437 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Fmo6-201ENSMUST00000178465 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm44741-201ENSMUST00000207503 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Rrm2-201ENSMUST00000020980 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm15577-201ENSMUST00000144350 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm13904-201ENSMUST00000121901 837 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm23644-201ENSMUST00000157856 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm20288-201ENSMUST00000222078 180 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 5330417H12Rik-201ENSMUST00000060348 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm8354-201ENSMUST00000189223 1373 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Apex2-203ENSMUST00000112720 4742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chic1Q8CBW7 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms