Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Hdac7Q8C2B3 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms