Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NischQ80TM9 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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