Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
AtmQ62388 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Srgap3-203ENSMUST00000113169 8300 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
AtmQ62388 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms