Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1700001L19Rik-201ENSMUST00000022007 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm45025-201ENSMUST00000206043 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Abca8b-202ENSMUST00000106669 5052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mill1-201ENSMUST00000066780 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC118222.1-201ENSMUST00000222184 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Grip1-207ENSMUST00000130387 2780 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc49-210ENSMUST00000166168 2784 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm11383-201ENSMUST00000121346 807 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Ly6a-202ENSMUST00000186526 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gpr83-201ENSMUST00000034408 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gapdhs-201ENSMUST00000074758 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2c37-201ENSMUST00000049178 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Fignl1-201ENSMUST00000047689 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Dcaf11-201ENSMUST00000072530 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1221-204ENSMUST00000217635 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Tnfrsf1b-201ENSMUST00000030336 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lrrc43Q3V0L5 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms