Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BB287469Q3UT53 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms