Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Grin2bQ01097 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms