Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Acad11-201ENSMUST00000047799 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Hoxd10P28359 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Hoxd10P28359 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd10P28359 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms