Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Sptan1P16546 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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