Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Naa20-204ENSMUST00000134759 1883 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm44167-201ENSMUST00000204957 1878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Hbq1b-201ENSMUST00000101387 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Igkv14-130-201ENSMUST00000103307 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm25613-201ENSMUST00000104012 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 2210408F21Rik-205ENSMUST00000138606 482 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Mss51-201ENSMUST00000022353 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Gm28038F7BCN9 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Gm28038F7BCN9 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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