Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Tas2r134-201ENSMUST00000070028 898 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Clrn2B2RVW2 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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