Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Spocd1B1ASB6 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms