Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Gm5538W4VSP6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm5538W4VSP6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5538W4VSP6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5538W4VSP6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm5538W4VSP6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm5538W4VSP6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm5538W4VSP6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm5538W4VSP6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm5538W4VSP6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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