Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac5Q9Z2V6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac5Q9Z2V6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms