Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
D17h6s53eQ9Z1R4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
D17h6s53eQ9Z1R4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms