Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lgr5Q9Z1P4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lgr5Q9Z1P4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms