Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx39bQ9Z1N5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx39bQ9Z1N5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms