Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Setbp1Q9Z180 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Setbp1Q9Z180 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Setbp1Q9Z180 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms