Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z175

Loxl3, Lysyl oxidase homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxl3Q9Z175 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Loxl3Q9Z175 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Loxl3Q9Z175 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms