Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dctn3Q9Z0Y1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms