Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Itsn2Q9Z0R6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itsn2Q9Z0R6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itsn2Q9Z0R6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms