Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap4s1Q9WVL1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ap4s1Q9WVL1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap4s1Q9WVL1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ap4s1Q9WVL1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ap4s1Q9WVL1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ap4s1Q9WVL1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms