Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Clcn5Q9WVD4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Clcn5Q9WVD4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms