Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stub1Q9WUD1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stub1Q9WUD1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms