Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MthfrQ9WU20 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MthfrQ9WU20 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms