Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Usp18Q9WTV6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp18Q9WTV6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp18Q9WTV6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms