Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Capn7Q9R1S8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn7Q9R1S8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn7Q9R1S8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn7Q9R1S8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Capn7Q9R1S8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Capn7Q9R1S8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms