Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psma4Q9R1P0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psma4Q9R1P0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms