Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slit2Q9R1B9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slit2Q9R1B9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms