Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trex2Q9R1A9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trex2Q9R1A9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms