Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NrkQ9R0G8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NrkQ9R0G8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NrkQ9R0G8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms