Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zeb2Q9R0G7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Zeb2Q9R0G7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zeb2Q9R0G7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms