Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BcamQ9R069 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcamQ9R069 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms