Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col4a3Q9QZS0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Col4a3Q9QZS0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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