Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2afyQ9QZQ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2afyQ9QZQ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms