Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copg1Q9QZE5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copg1Q9QZE5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms