Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnt3Q9QZ47 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnt3Q9QZ47 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms