Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkp3Q9QY23 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pkp3Q9QY23 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms