Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf354bQ9QXT9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf354bQ9QXT9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Znf354bQ9QXT9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms