Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Kcnip3Q9QXT8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms