Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA6

Slc7a9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a9Q9QXA6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Slc7a9Q9QXA6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc7a9Q9QXA6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms