Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cdkl2Q9QUK0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkl2Q9QUK0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms